cat test.txt.org | tr \\n \\r\\n > test.txt

以上のコマンドでtest.txt.orgのファイルの\nが\r\nに変換されてtest.txtとして保存される。

なんか隣の人に言わせると\rと指定するのはキケンで、バイナリでテキストファイルを開いて文字コードで削除(追加)するのが安全らしい。。。